Voir la source de Openbioréacteur

{{Tuto Details
|Type=Technique
|Area=Science & Biologie
|Description=Un appareil qui sert à cultiver des micro-algues
|Difficulty=Difficile
|Cost=500
|Currency=EUR (€)
|Duration=3
|Duration-type=jour(s)
|Licences=Attribution - Partage dans les Mêmes Conditions (CC BY-SA)
|Main_Picture=Openbior_acteur_IMG_20160824_132802.jpg
}}
{{Introduction
|Introduction=Un bioréacteur, appelé également fermenteur ou propagateur, est un appareil dans lequel on multiplie des micro-organismes (levures, bactéries, champignons microscopiques, algues, cellules animales et végétales) pour la production de biomasse (écologie), ou pour la production d'un métabolite ou encore la bioconversion d'une molécule d'intérêt.
Dans les années 1800, Pasteur, Kutzing, Schwann, et Cagniard-Latour ont démontré que la fermentation était causée par des levures, qui sont des organismes vivants (Hochfeld1, 2006). Le terme « fermentation » prend en compte aussi bien le métabolisme aérobique qu’anaérobique. Elle consiste à multiplier la biomasse de microorganismes vivants, et éventuellement à utiliser son métabolisme.
}}
{{Materials
|Material='''Connecteurs'''

*8 connecteurs 6-branches
*2 connecteurs 4-branches
*2 connecteurs 3-branches


'''Tubes profilés''' 

*4 tubes de 30 cms 
*4 tubes de 30 cms
*1 tube de 30 cms

*2 tubes de 35 cms
*2 tubes de 21 cms
*2 tubes de 12 cms
*4 tubes de 9 cms
|Tools=*scie à métaux (ou scie circulaire)
*guide pour scie à métaux
|Step_Picture_00=Openbior_acteur_hackpad.com_BEAae4NZUXr_p.63036_1467839865054_undefined.png
|Step_Picture_01=Openbior_acteur_hackpad.com_BEAae4NZUXr_p.63036_1467839891562_undefined.png
|Step_Picture_02=Openbior_acteur_hackpad.com_BEAae4NZUXr_p.63036_1467839945187_undefined.png
|Step_Picture_03=Openbior_acteur_hackpad.com_BEAae4NZUXr_p.63036_1467839989352_undefined.png
}}
{{Separator}}
{{Tuto Step
|Step_Title=Plan du bioréacteur
|Step_Content=* 1-Capteurs sans fils (hardware non implémenté)
* 2-Contrôleur chauffage, agitation magnétique
* 3-Contrôle des pompes,  réception des données capteurs, et émission sur serveur annexe.
* 4-Intrant
|Step_Picture_00=Openbior_acteur_bioreacteur.jpg
}}
{{Tuto Step
|Step_Title=Construction de la structure plastique
|Step_Content=La structure plastique rigide va accueillir tout les composants du bioréacteur. Elle est réalisée à partir du kit [http://www.leroymerlin.fr/v3/p/produits/connecteur-pvc-mat-l-23-5-mm-diam-20-5-mm-e17475 "Combitech"] composé de profilé et de connecteurs, cependant il peut tout à fait  être réalisé en bois, en se référent au plan.

Le but est d'assembler des connecteurs avec des tubes carré  pvc mat pour mettre en place la structure selon les côtes.

*Procurez vous les tubes profilés
*Coupez les à la scie à métaux (avec guide), ou à la scie à onglets  pour plus de précision.
* Réalisez le montage comme indiqué sur le schéma coloré
|Step_Picture_00=Openbior_acteur_bioreactor_cleaned2.png
|Step_Picture_01=Openbior_acteur_20161009_152111.jpg
|Step_Picture_02=Openbior_acteur_20161009_152321.jpg
|Step_Picture_03=Openbior_acteur_20161009_154747.jpg
|Step_Picture_04=Openbior_acteur_20161009_154013.jpg
|Step_Picture_05=Openbior_acteur_20161009_154021.jpg
}}
{{Tuto Step
|Step_Title=Découpe du plancher bombonne de croissance
|Step_Content=Le plancher va accueillir le bocal dans lequel vous allez cultiver les algues, mais dans lequel vous allez également placer les bouteilles de nutriments. On va fixer dessus plus tard le caisson d'alimentation électrique et l'agitateur magnétique. Il peut être réalisé avec du contreplaqué ou du médium à la découpe laser (svg fourni),(réglages non fourni), ou avec une scie à bois (ou à métaux) et une perçeuse conformément au plan.
|Step_Picture_00=Openbior_acteur_support_bioreacteur.svg
|Step_Picture_01=Openbior_acteur_20161009_154828.jpg
}}
{{Tuto Step
|Step_Title=Découpe et assemblage du boîtier hardware
|Step_Content='''Matériaux :''' 

*Vis de fixation (avec écrou) du boitier hardware sur la structure PVC 
[4 vis. w:6mm, l:6cm tête bombée]
Perçage à réaliser à la main.

*Vis de fixation pompes péristaltiques  (avec écrou)  
[8 vis w:3mm, l:2cm (au moins) tête plate]
Perçage à réaliser à la main.


*<s>Vis de fixation raspberry (avec écrous)
[4 vis w:3mm, l:2cm (au moins) tête plate]</s>


A la découpeuse laser, découpez la planches de contreplaqué 10 mm en suivant le fichier svg ci-joint. 
Placez la planche que vous utiliserez comme fond de boîtier du coté connecteur 3-branches,  puis fixez en vissant comme indiquez sur l'image.
|Step_Picture_00=Openbior_acteur_caseplans1.svg
|Step_Picture_01=Openbior_acteur_20161009_162309.jpg
|Step_Picture_02=Openbior_acteur_20161009_161513.jpg
|Step_Picture_03=Openbior_acteur_20161009_162322.jpg
}}
{{Tuto Step
|Step_Title=Placement des moteurs DC
|Step_Content=Sur le panneau perforé de 4 cercles, fixez les moteurs et vissez-les.
|Step_Picture_00=Openbior_acteur_20161009_162309.jpg
}}
{{Tuto Step
|Step_Title=Installation des tuyaux d'alimentation
|Step_Picture_00=Openbior_acteur_20161009_162312.jpg
}}
{{Tuto Step
|Step_Title=Fabrication et installation du ventilateur pour l'agitation magnétique
|Step_Picture_00=Openbior_acteur_20161009_161149.jpg
|Step_Picture_01=Openbior_acteur_20161009_162130.jpg
|Step_Picture_02=Openbior_acteur_20161009_162009.jpg
|Step_Picture_03=Openbior_acteur_20161009_162009.jpg
|Step_Picture_04=Openbior_acteur_20161009_162130.jpg
}}
{{Tuto Step
|Step_Title=Découpe et fixation du caisson  ATX
|Step_Picture_00=Openbior_acteur_20161009_161518.jpg
|Step_Picture_01=Openbior_acteur_20161009_161551.jpg
|Step_Picture_02=Openbior_acteur_20161009_162030.jpg
}}
{{Tuto Step
|Step_Title=Placement de la bonbonne de croissance et des bouteilles d'intrants
|Step_Content=Vis de fixation (avec écrou) du boitier hardware sur la structure PVC. 
4 vis. w:6mm, l:6cm tête bombée

Vis de fixation (avec écrou) du plateau principal. 
12 vis. w:6mm, l:6cm tête bombée


Collez les éléments correspondant aux différents assemblages les uns aux autres avec la colle à bois. Vissez l'assemblage qui servira  de support à la bonbonne de croissance conformément au plan. Collez les assemblages qui serviront de support aux bonbonnes d'intrants conformément au plan.
Vous pouvez maintenant placer les bonbonnes d'intrant et le placer sur le plateau en le collant avec la colle a bois. Quand vous placerez ensuite la bonbonne de croissance par vissage, vous constaterez qu'il y a du jeu, vous devez caler cette bonbonne avec des pailles de bois collées à l'intérieur du socle.
|Step_Picture_00=Openbior_acteur_cerclebionew.svg
|Step_Picture_01=Openbior_acteur_20161009_154849.jpg
|Step_Picture_02=Openbior_acteur_20161009_160847.jpg
|Step_Picture_03=Openbior_acteur_20161009_160958.jpg
|Step_Picture_04=Openbior_acteur_20161009_162956.jpg
}}
{{Tuto Step
|Step_Title=Intégration Raspberry
|Step_Content=Il faut fixer le raspberry (la boite en plastique) au fond du compartiment hardware à l'emplacement indiqué.
Il doit être  alimenté  en 5v, pour ce faire, il faut l'alimenter via l'ATX.
Récupérez un câble mâle microusb/usb  assez long. (1m50), coupez la partie usb, vous la branchez à un fil rouge et un fil noire de l'ATX  en fonction des couleurs du câble usb. normalement votre raspberry devrait s'allumer. :dart:  .
|Step_Picture_00=Openbior_acteur_20161009_162015.jpg
|Step_Picture_01=Openbior_acteur_20161009_162020.jpg
|Step_Picture_02=Openbior_acteur_20161009_162030.jpg
}}
{{Tuto Step
|Step_Title=Intégration Arduino et Adafruit motorshield
|Step_Content=Il faut fixer à l'aide les vis de 3mm de large et 2 cm de long a tête plate, le module arduino  à  l'emplacement indiqué dans le compartiment hardware. Ensuite, fixez le shield adafruit au arduino avec un cable usb, usb2. Une alimentation annexe est nécessaire pour alimenter les moteurs en 12v.
Pour se faire vous devez alimenter le Adafruit moteur shield grâce au 12V de l'ATX  (câble jaune et noir) que vous souderez avec un connecteur d'alimentation Jack adéquat (voir ref  matériel).
}}
{{Tuto Step
|Step_Title=Montage et Connexion des moteurs
|Step_Content=Astuce  : Pour connecter facilement vos moteurs au adafruit motorshield sans vous arracher les cheveux, soudez des petits embout mâle aux bornes de vos moteurs.
Maintenant vous pouvez connecter vos moteurs au shield adafruit avec des fils femelle-femelles.
}}
{{Tuto Step
|Step_Title=Montage et Connexion des sondes
|Step_Content=Percez un trou de 6 mm au centre du couvercle de la bombonne de croissance,  dans lequel vous allez faire passer
une tige filetée inox  de 6 mm  de diamètre et de 14 cm de long, fixé par des écrous  (voir image).
Il faut ensuite fixé avec des écrous le porte sonde réalisé à l'impression 3D sur la tige fileté.
|Step_Picture_00=Openbior_acteur_20161009_164904.jpg
}}
{{Tuto Step
|Step_Title=Installation du software
|Step_Content=1-Paramétrage, démarrage  des pompes : 
-Installation Linux sur raspberry : (voir lien annexe)
-Installation arduinoIDE sur ordinateur de bureau
-Récupérer le script sur github et charger le code sur arduino uno
-Lancer le script récupéré sur github dans un cron


2-Paramétrage de la webcam
-Brancher la webcam 
-Vérifier que la webcam fonctionne correctement et la visser  correctement


3-Paramétrage de la connection au serveur de monitoring:
-Suivre le tutoriel du site
-Récupérer la clé
-Lancer le script récupéré sur github dans un cron avec votre clée
}}
{{Notes}}
{{Tuto Status}}